Pandemie 2020: Wie ein jeder helfen kann.

 
Sehr viele Wissenschaftler und Firmen weltweit sind auf der Suche nach Therapien und der wichtigsten Waffe im Kampf gegen SARS-CoV-2: einem Impfstoff. Wie der momentane Stand der Dinge ist, werde ich in einem separaten Beitrag beschreiben und bewerten.
 
Diese Suche allerdings benötigt hauptsächlich folgende drei Dinge:
 
1. Fähige und hart arbeitende Wissenschaftler und Firmen aus dem
    Bereich der Life Sciences.
 
2. Geld. Unmengen davon, aber immer noch ein Bruchteil dessen,
    was unsinnige und fehlgeplante Projekte, die Rettung der vielen Investmentbanken
    oder das muntere jährliche Aufrüsten mit Waffen kosten.
 
3. Rechenpower. Viele Berechnungen, z.B. wie Proteine sich falten (was
    wiederum für deren richtige Funktion wichtig ist), an welchen Rezeptoren
    sie wie stark binden und was dann passiert und vieles mehr muss
    modelliert bzw. simuliert werden, um zielgerichteter vorgehen zu   
    können. Insbesondere bei der jetzigen Krise, in der jeder Tag zählt. Leider
    ist Rechenpower begrenzt bzw. nicht jedem zugänglich.

Und genau hier setzt das im Jahr 2000 von der Stanford University gestartete und nun von der Washington University School of Medicine Projekt in St. Louis fortgeführte Projekt Folding@Home (FAH) an.

Das geniale Prinzip: jeder interessierte Bürger (oder auch Neudeutsch Citizen Scientist), kann einen Client (eine kleine Software) von der weiter oben verlinkten Seite herunterladen und installieren. Dieser Client stellt dann diversen Projekten zur Erforschung von so schlimmen Erkrankungen wie Krebs, Parkinson, aber auch Covid-19 die nätige Rechenpower des heimischen PCs zur Verfügung, um die vielen Berechnungen schneller durchführen zu können.

Wann immer euer PC einfach nichts tut oder ihr ihn dann extra einschaltet und danach natürlich auch den Client startet, werden automatisch kleine Teilprojekte heruntergeladen, berechnet (ihr könnt einstellen, wie viel eurer Rechenpower dafür verwendet werden soll und ob das Ganze nur im Ruhezustand oder auch während ihr am PC arbeitet geschieht) und das fertige Ergebnis dann an die Forscher übermittelt. Es ensteht also virtuell ein großer Verbund an Rechnern, im Prinzip ein dezentraler Supercomputer. Der Name stammt von einer der Hauptaufgaben dieses Tools: der Berechnung der möglichen Faltung einzelner Medikamentenkandidaten, welche oftmals Proteine sind. Eine sehr wichtige Berechnung, da nur korrekt gefaltete Proteine das tun, was sie sollen und falsch gefaltete Proteine sogar Krankheiten auslösen können.

Die Nutzung ist super simpel und wird auch gut auf der dazugehörigen Website beschrieben. Wer wissen möchte, wie und wann er denn direkt an der Forschung zu Covid-19 teilnimmt, dem empfehle ich die Lektüre folgender FAQ-Seite:

[FAQ] SARS-CoV-2 (COVID-19) projects and FAH

Ich bitte darum, zahlreich mitzumachen, insbesondere wenn euer PC doch oftmals einfach nur vor sich hinbrummt. Alles andere ist einfach nur verschwendete Rechenpower und Strom. Wir allem müssen an einem Strang ziehen, denn ohne Medikamente und Impfstoffe wird sich diese Pandemie noch ewig hinziehen.

Vielen Dank und bei Fragen stehe ich jederzeit gerne zur Verfügung.

Mit Nanoskopie Moleküle sichtbar machen

Pixabay; DasWortgewand

Nanoskopie? Nie gehört. Liegt sicherlich darin, dass diese hochauflösenden Mikroskope eine noch relativ junge Entwicklung sind.

Mikroskope gehören zu den bahnbrechendsten Erfindungen der Neuzeit. Ohne diese Geräte wären zahlreiche Entdeckungen innerhalb der Biologie nicht möglich gewesen. Mit Hilfe der u.a. durch niederländische Linsenmacher Ende des 16. Jahrhunderts entwickelten ersten Lichtmikroskope, deren Linsen durch den ebenfalls niederländischen Naturforscher Antoni Van Leeuwenhoek stark verbessert wurden, konnten zum ersten Mal Einzeller (sogenannte Protozoen), aber auch Bakterien sichtbar gemacht und somit in die geheimnisvolle Welt des Mikrokosmos eingetaucht werden. Technisch gesehen machen Mikroskope nichts anderes als das Licht, welches sich seinen Weg durch ein Objekt bahnt, durch die spezielle Anordnung von diversen Linsen zu brechen und dadurch zu vergrößern. Wer mehr zu den physikalischen Prinzipien der Lichtmikroskope erfahren möchte, der kann dies sehr verständlich beschrieben hier nachlesen.

Allerdings sind klassische Lichtmikroskope physikalischen Grenzen bezüglich der optischen Auflösung unterworfen, dem sogenannten Abbe-Limit. Dieses begrenzt die mögliche optische Auflösung eines klassischen Lichtmikroskops. Will man also zwei nebeneinander liegende Punkte als einzelne Punkte wahrnehmen, so dürfen diese nicht näher als die halbe Wellenlänge des genutzten Lichts zusammenliegen. Da blaues Licht mit einer Wellenlänge von 400 Nanometern (nm) die unterste Grenze des Lichtspektrums darstellt, welches wir wahrnehmen können, liegt das Abbe-Limit somit bei 200 nm.

Das Überwinden dieser Grenze aber würde ungeahnte neue Erkenntnisse aus Gebieten wie der Zellbiologie oder Chemie liefern, wäre es doch dann möglich Moleküle in Echtzeit beobachten zu können. Genau dies hatten Forscher um Prof. Dr. Stefan Hell vom Max-Planck-Institut für biophysikalische Chemie und seine US-Kollegen Eric Betzig und William Moerner durch die Entwicklung des STED-Mikroskops möglich gemacht, wofür sie dann auch den Nobelpreis für Chemie im Jahre 2014 bekamen. Auflösungen bis zu 20 nm und live Bilder aus dem Inneren einer Zelle wurden nun möglich. Wie genau die fluoreszenz-basierte STED-Mikroskopie funktioniert veranschaulicht dieses sehr informative Video der Max-Planck-Gesellschaft.

Im Prinzip sehr simpel: möchte man bestimmte Moleküle hochaufgelöst beobachten, so markiert man diese zuerst mit einem Fluoreszenz-Farbstoff, welcher an dieses Molekül bindet und bei Bestrahlung mit einem Laser in einer bestimmten Farbe aufleuchtet. Liegen die Moleküle nun jedoch sehr nah beieinander, so leuchten sie nun natürlich alle auf, was aber zu einem einzigen Lichtfleck führt und man nichts erkennt. Der Trick ist nun einige der Moleküle wieder auszuknipsen und somit die Intensität der noch übrig gebliebenen Moleküle zu senken und somit die Auflösung zu erhöhen. Erreicht wird dies durch einen zweiten, doghnut-förmigen Laser, sprich einem Laser, der ringförmig strahlt und die in der Mitte des Lasers befindlichen Moleküle unberührt, sprich angeknipst lässt. Ein geniales Prinzip.

Dank Wissenschaftlern wie den zuvor genannten und vielen anderen, die Ihre Zeit in die Verbesserung der sogenannten Nanoskopie steckten, erlebte die Grundlagenforschung einen enormen Aufwind. Da Stillstand Wissenschaftlern fremd ist, ging auch die Entwicklung der Nanoskopie weiter. Mit dem MINFLUX getauften System, an dem ebenfalls Prof. Hell beteiligt ist, geht die Reise weiter in die Tiefen des Mikrokosmos, nun auf unfassbare 2.1 nm bzw. 1.2 nm Auflösung.

Der neue Vogelgrippe-Virus. Grund zur Sorge?

​Aus aktuellem Anlass möchte ich hier grundlegendes zum neuen Vogelgrippe-Subtyp H5N8 vermitteln. 

Wie auf dieser Karte des Friedrich-Löffler-Instituts gut zu sehen ist (https://www.fli.de/fileadmin/FLI/Images/Tierseuchengeschehen/H5N8/2016/Map_AI_HPAI_2016-11-15_16-00.jpg)

mehren sich zwar die Fälle der an diesem Virus gestorbenen Vögel. Dennoch besteht kein Grund zur Panik. Zwar wird dieser Virus-Subtyp wohl auch ähnlich lange infektiös bleiben, wie der bekannte Subtyp H5N1 (>30 Tage bei 0 °C oder 6 Tage bei 37 °C), dennoch kann man sich sehr leicht vor einer Infektion schützen.

Grundsätzlich gilt:

1. Keine toten Wildvögel anfassen

2. Geflügel (auch wenn eine Durchseuchung unserer Lebensmittel sehr unwahrscheinlich ist) separat von anderen Lebensmitteln lagern und sehr gut durchbraten. 

3. Benutzte Küchenutensilien und die Hände mit mindestens warmem Wasser und Seife gründlich waschen. 

Influenzaviren sind und bleiben nun einmal ein Teil unseres Lebens, wie alle anderen Viren auch, doch kann mit diesen einfachen Maßnahmen und einer gesunden Portion Verstand eine Infektion, oder eine Epidemie, verhindert werden. 

Das Bild zeigt die Anfänge einer Infektion mit einem Influenza A-Virus. 

Bildquelle: http://www.cdc.gov/flu/images/influenza-virus-nolabels.jpg

So schön kann Forschung sein

EM-Aufnahmen

Ein Grund, warum mich schon immer die Forschung faszinierte, sind derartig schöne Fotos. Aufgenommen mit Mikroskopen jeglicher Art und, im Falle elektronenmikroskopischer (EM-) Aufnahmen, zudem noch nachcoloriert, da ja diese technisch bedingt schwarz-weiß sind.

Die Picture Show von Cell Press entführt uns dazu in die Welt des mikroskopisch Kleinen und präsentiert uns die besten Bilder aus dem Jahre 2014.

Genießt diese wundervollen Bilder…

http://www.cell.com/pictureshow/bestof2014